Al hacerte el cambio de bomba, puede haber varios factores que afecten a la bomba esponjosa.
No creo que sean discos ya que notarias en la bomba al girar la rueda como se mueve la maneta ligeramente.
Mi opinión es que alguno de los racor o purgadores no se han apretado bien y por esto y el calor haya entrado algo de aire en el circuito.
Normalmente, tras reposar la moto, es cuando se notan las burbujas en el circuito.
No dudaría en ir al taller donde te montaron la bomba para que te revisen (antes de purgar) si algún purgador o racor esta lo suficientemente flojo como para que entre aire. Tras revisarlo, purgar y probar.
No será el primer taller que por prisas, no aprieta algo correctamente.